Bardzo piękna praca A. Palladio, który nie widział jej ukończenia; ma wiele wspólnego z kościołem Redentore. Wnętrze w postaci krzyża łacińskiego z nawą i dwoma nawami zawiera dzieła mistrzów takich jak J. Tintoretto, J. Palma il Giovane i V. Carpaccio.

Prezbiterium jest szczególnie interesujące, zawiera dwa arcydzieła J. Tintoretto: Ostatnia wieczerza i Manna z nieba.
W znacznej ciągłości z projektem Refektarza, zaledwie kilka lat później Palladio podjął się budowy wielkiego kościoła klasztornego, niewątpliwie jego najbardziej złożonego i trudnego projektu od czasu budowy loggii Bazyliki w Vicenzy. Wielkie bogactwo klasztoru i potężnych Congregazione di Santa Giustina podyktowało skalę przedsięwzięcia; precyzyjne wymagania liturgiczne i tradycje zakonu determinowały wybór planu podłużnego, a także obecność chóru, prezbiterium, skrzyżowania, nawy i kopuły.

Od listopada 1565 r. do marca 1566 r. projekt Palladio został opracowany na wzór, który wywarł tak wielkie wrażenie na Giorgio Vasarim podczas jego wizyty w Wenecji. W styczniu następnego roku sporządzono umowy z murarzami i budowniczymi, zgodnie z którymi muszą przestrzegać profili formowania i pomiarów wskazanych przez Palladio. W 1576 r. Zamknięto ogólną strukturę. Wiele lat później, w latach 1607–1611, obecna fasada została rzeczywiście zbudowana, a ostatnie badania wykazały, że jest ona daleka od pierwotnych życzeń Palladio. Podobnie jak Leon Battista Alberti przed stuleciem, Palladio wziął wielkie kąpiele starożytnego Rzymu za swój wzór. W planie można wyraźnie rozróżnić cztery jednostki przestrzenne wymyślone przez Palladio, tworząc ciało budynku.

Podążając za nawą o sklepieniu kolebkowym, przed którą ustawione są trzy sklepienia krzyżowe - prawdziwe i właściwe frigidarium z łaźni rzymskich - dochodzi do niespodziewanego bocznego rozszerzenia absyd i pionu wielkiego bębna i kopuły. Obok tego ostatniego Palladio ustawił niezwykle przestudiowaną przestrzeń prezbiterium, przez którego ekran kolumn jest widoczny, chór, stanowiący przestrzeń wewnętrzną na zewnątrz, prawie tak, jakby ekran kolumnowy był pronaos willi, przez którą widać było krajobrazy. Sekwencja przestrzeni biegnie wzdłuż bardzo emanującej osi centralnej, co gwarantuje ciągłość i przejście z jednej strefy kościoła do drugiej.

W szczegółach zamówienia Palladio szukał największej różnorodności, odmawiając łatwych i przewidywalnych rozwiązań, i położył duży nacisk na plastyczną siłę członu architektonicznego: zaangażowane kolumny wykraczają poza swoje średnice, pilastry wystają znacznie, a ciągłość pionowa jest nieustannie poszukiwana w elementach zamówienia. Rezultatem jest budynek wielkości, który wskrzesza przestrzenne emocje starożytnych rzymskich osiągnięć.